Sorta il 13 giugno 1945 inizialmente come U.L.S.E.A. - Unione Lombarda Spedizionieri ed Autotrasportatori - il Consiglio Direttivo del 19 giugno 1945 ne adottò l'attuale denominazione - ALSEA - Associazione Lombarda Spedizionieri ed Autotrasportatori.
Il 13 aprile 1946 i rappresentanti di ALSEA parteciparono alla costituzione della Confetra - Confederazione Generale del Traffico e dei Trasporti, oggi Confederazione Generale Italiana dei Trasporti e della Logistica. Successivamente, l'11 giugno 1946 i rappresentanti di ALSEA parteciparono alla costituzione della Federazione Nazionale Spedizionieri, oggi Federazione Nazionale delle Imprese di Spedizioni Internazionali.
Nel 1979 ALSEA aderi' alla Federazione Nazionale Corrieri, oggi FEDIT. Nel 2012 insieme alle altre associazioni lombarde di categoria (ASCAB BRESCIA, ASCO BERGAMO, ASEA VARESE , ALSEA COMO) partecipò alla costituzione di CONFETRA LOMBARDIA